담석의 원인은 아직까지 완전히 규명되지는 않았다. 다만, 담즙의 울체, 담도의 감염, 담즙의 이상 성분, 식생활에 있어 지방질의 과다 섭취 등이 서로 관계하면서 좋지 않는 조건이 조성되어 담석이 발생한다는 설이 유력하다.
지방질이 많은 음식을 과식하고, 식사를 불규칙하게 하면 담즙 흐름의 리듬이 깨져 담석이 생기기 쉽다는 설도 있다. 또 스트레스가 심하면 담즙의 흐름이 방해를 받게 되므로 담석의 원인이 된다.
폭음, 폭식, 임신, 그리고 육체적, 정신적 피로도 주의해야 한다.
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